SnapGene
遺伝子工学実験をより正確に、よりスムーズに
製品トライアル版SnapGene Viewer

遺伝子工学実験支援ソフトウェア

SnapGeneは、DNAクローニングやPCRの計画、視覚化、記録を手早く簡単に行うことができる遺伝子工学実験支援ソフトウェアです。フィーチャーのアノテーションやプライマーのデザインの実行もスムーズに行え、研究者の日々のリサーチを支援します。

SnapGene_計画

クローニング作業計画の作成にかかる時間とコストの削減

  • 情報量が豊富なウィンドウで、一般的なクローニングやPCRの手法をシミュレート
  • どのように組み立てられるのかを一目で確認できるインターフェイス
  • DNAメチル化やリン酸化などの詳細を記録し、よくあるケアレスミスを特定し回避
SnapGene_視覚化

コンストラクトの可視化によるスムーズな管理作業

  • 核酸やアミノ酸配列の視覚化
  • アノテーションが付いたプラスミドマップの作成と閲覧
  • DNA配列のスキャンし、豊富なアノテーションを自動で追加
  • コンストラクトに対するシークエンス結果を視覚化しクローニング結果を確認
SnapGene_記録

シミュレーションした手順を自動的に文書化

  • 配列編集やクローニング手順の履歴をグラフィカルに自動生成
  • コンストラクトの元となった配列と現在の配列を比較したり、関連部分の強調を通して、クローニング作業の過程を視覚的にに再現
  • Undo(元に戻す)機能を使うことで修正も容易

SnapGeneが選ばれる理由

SnapGene_遺伝子クローニングの手順を最適化

遺伝子クローニングの手順を最適化

遺伝子クローニングの作業に必要な手順をシミュレーションすることができます。制限酵素認識配列の確認やプライマー設計だけでなく、遺伝子の向きやフレームチェックなどを通して正しいコンストラクトを提供します。詳細


SnapGene_クローニング作業の視覚化

クローニング作業の視覚化

遺伝子工学の作業において自分が何をしているのかを可視化することができれば、問題が生じた時に原因を特定しやすく、またクローニング作業の心理的なハードルも大きく下がります。SnapGeneは、作業内容の理解と把握を直感的に可能にするインターフェイスを提供します。詳細


SnapGene_作業記録の自動化

作業記録の自動化

SnapGeneはドキュメント作成を自動で行うので、作業記録を別途作成する必要はありません。プラスミドのコンストラクト作成に関わるシークエンス編集やクローニング手順の確認・共有を簡単に行うことができます。詳細

分子クローニングの基礎から応用へ

遺伝子クローニングの手順を最適化

SnapGene_遺伝子クローニング手順の最適化_2

スピーディーで正確、ユーザーフレンドリーなインターフェイス

  • コンストラクトを可視化することでクローニング手順の設計上の問題点を直感的に特定および修正することが可能
  • 既存のプライマーを使用して標準的なPCRをシミュレートしたり、SnapGeneを利用し新たにプライマーを設計することも可能
  • 専用のクローニングツールにより、主要な分子クローニング技術に対応したコンストラクト設計を正確かつ迅速に実施

クローニング

制限酵素クローニング

SnapGene_制限酵素クローニング

使用する制限酵素の選択からクローニング後のイメージまで、シミュレーションは数秒で終わります。プロトコルに設計上の欠陥がある場合、そのエラーを発見して修正することもできます。

Gateway®cloning

SnapGene_Gateway Cloning

Gateway cloningで必要なプライマーを自動で設計します。ユーザー側で行う操作は、結合したいDNAフラグメントを選択するだけです。

Gibson Assembly®

SnapGene_Gibson Assembly

Gibson Assemblyで必要な必要なプライマーを自動で設計します。ユーザー側で行う操作は、結合したいDNAフラグメントを選択するだけです。

In-Fusion® Cloning

SnapGene_In-Fusion Cloning

In-Fusion® Cloningで必要なプライマーを自動で設計します。ユーザー側で行う操作は、融合したいDNAフラグメントを選択するだけです。

TOPO® Cloning

SnapGene_TA/GCクローニング

TOPO® cloning で必要なプライマーを自動で設計します。ユーザー側で行う操作は、増幅したいDNAフラグメントを選択し、組み込まれているリストからTOPO®クローニングベクターを選ぶだけです。

TAまたはGCクローニング

SnapGene_TA/GCクローニング

市販されている様々な直鎖化TAおよびGCクローニングベクターのデータが既に組み込まれています。シミュレーションはもちろん、データから目的にあった最適なベクターを選ぶ作業も可視化します。

クローニング計画を検証し、技術的なエラーを回避

クローニング作業の視覚化

SnapGene_クローニング計画を検証

クローニング計画を検証し、技術的なエラーを回避

  • SnapGeneのフィーチャーデータベースや独自のカスタムフィーチャーを使用し、プラスミドのフィーチャーへのアノテーション追加が可能
  • 制限酵素サイト、フィーチャー、プライマー、ORF、翻訳などをプラスミドマップやシークエンスビューで詳細に表示
  • 柔軟なアノテーションコントロールと視覚化コントロールでプラスミドマップを自分好みにカスタマイズ

SnapGene_アライメントツールによる配列確認

アライメントツールによる配列の確認

  • 強力なAlign to Reference(リファレンス配列と合わせる)ツールを使用し、シークエンスされたコンストラクトとシミュレーションされたコンストラクトの一致を検証
  • Clustal Omega、MAFFT、MUSCLE、T-Coffeeなどの信頼できるアルゴリズムを使用したペアワイズおよびマルチプルアラインメント
  • CAP3を使って、サンガー・シークエンス・リードの完全なコンティグを構築

SnapGene_アガロースゲル電気誘導シミュレーション

アガロースゲル電気泳動の泳動パターンをシミュレーション

  • SnapGeneのゲルシミュレーションアルゴリズムは、実験室で見るアガロースゲル電気泳動の泳動パターンを再現
  • レーン数、アガロースの割合、実行時間、MWマーカーのフルセットなどの要素を柔軟にカスタマイズ可能
  • 各レーンの詳細なフラグメント情報により、目的のバンドを記録し識別

自動文書化とスムーズなデータ交換のための設定

作業記録の自動化

SnapGene_作業記録の自動化_2

グラフィカルな履歴を自動で作成

  • 操作手順やドキュメントの変更を視覚的に記録
  • 履歴、遺伝子マップ、シークエンスビューに履歴の色を表示
  • 完全に復元可能なシークエンス履歴のドキュメントへの埋め込み

SnapGene_データの変換と共有

データの変換と共有

  • シークエンス、ファイル、各種マップの保存、検索、共有、整理
  • 共有可能なドライブ、サーバー、クラウドサービスに保存されたシークエンスを使用しての共同作業が可能
  • 多くの一般的なファイルフォーマットから、シークエンス、アノテーション、その他のメタデータを読み取り、それらをエクスポートすることも可能

多くのユーザーに支援されています

SnapGeneは分子生物学研究を支援する強力なツールとして多くの研究者に利用されています。またSnapGeneを使用した論文は、医学・ライフサイエンス分野のジャーナルに広く掲載されています。

世界中の研究者に評価されています

SnapGeneの使い勝手の良さに、すぐに私の研究室に導入を決意しました。まず最初にSnapGeneでクローニングを行い、実験計画における潜在的課題を見つけてから作業を行っています。おかげで、時間とコストを大幅に減らすことができるようになりました。

"SnapGene is so easy to use that my lab adopted it instantly. It saves a lot of time and money as we now do all our cloning in SnapGene first and catch any snags in the strategy before they hold us up."


A. Matouschek
Northwestern University

SnapGeneはとても素晴らしいソフトです。すぐに使い始めることができるほど簡単なのに、優れた機能が豊富で、私がクローニングに求めている点をすべてカバーしています。クローニングを行う人にぜひお勧めしたいソフトウェアです。

"SnapGene is awesome. It is straightforward enough to start using right away, yet rich with sophisticated features that cover all of my cloning needs. I recommend this software to anyone who clones DNA."


D. Strongin
Fred Hutchinson Cancer Center

難しいクローニングに自信を持って、そして最小限の労力で取り組むことができるようになり、私の研究室でのリサーチが劇的に変わりました。私にとってSnapGeneはなくてはならない存在です。

"I just want to say that I LOVE SnapGene. It has dramatically altered the research that my lab does, giving us the confidence to take on difficult cloning with minimal effort! "


D. Bryant
University of Glasgow

SnapGeneが使用された論文

Immunity 2018
Salmonella Persist in Activated Macrophages in T Cell-Sparse Granulomas but Are Contained by Surrounding CXCR3 Ligand-Positioned Th1 Cells.
Goldberg MF, Roeske EK, Ward LN, Pengo T, Dileepan T, Kotov DI, Jenkins MK.
Arch. Virol. 2018
Characterization of the lytic archaeal virus Drs3 infecting Methanobacterium formicicum.
Wolf S, Fischer MA, Kupczok A, Reetz J, Kern T, Schmitz RA, Rother M.
Nature 2018;564:287-290
Dna2 nuclease deficiency results in large and complex DNA insertions at chromosomal breaks.
Yu Y, Pham N, Xia B, Papusha A, Wang G, Yan Z, Peng G, Chen K, Ira G.
J. Econ. Entomol. 2018
Geographical Distribution of Ectropis grisescens (Lepidoptera: Geometridae) and Ectropis obliqua in China and Description of an Efficient Identification Method.
Li ZQ, Cai XM, Luo ZX, Bian L, Xin ZJ, Liu Y, Chu B, Chen ZM.
J Vis Exp 2018
CRISPR-mediated Genome Editing of the Human Fungal Pathogen Candida albicans.
Evans BA, Pickerill ES, Vyas VK, Bernstein DA.
Front Microbiol 2018;9:2736
Utilization of a Strongly Inducible DDI2 Promoter to Control Gene Expression in Saccharomyces cerevisiae.
Lin A, Zeng C, Wang Q, Zhang W, Li M, Hanna M, Xiao W.
Curr Protoc Mouse Biol 2018;8:e56
Adeno-Associated Virus Production, Purification, and Titering.
Chen YH, Keiser MS, Davidson BL.
Cell Rep 2018;25:2132-2147.e7.
A Dock-and-Lock Mechanism Clusters ADAM10 at Cell-Cell Junctions to Promote α-Toxin Cytotoxicity.
Shah J, Rouaud F, Guerrera D, Vasileva E, Popov LM, Kelley WL, Rubinstein E, Carette JE, Amieva MR, Citi S.
J. Hered. 2018.
Hybrid sterility with meiotic metaphase arrest in intersubspecific mouse crosses.
Nishino R, Petri S, Handel MA, Kunieda T, Fujiwara Y.
Cell Host Microbe 2018;24:804-816.e6.
Essential cGMP Signaling in Toxoplasma Is Initiated by a Hybrid P-Type ATPase-Guanylate Cyclase.
Brown KM, Sibley LD.
Cell Rep 2018;25:1856-1871.e6.
Wnt Secretion Is Regulated by the Tetraspan Protein HIC-1 through Its Interaction with Neurabin/NAB-1.
Tikiyani V, Li L, Sharma P, Liu H, Hu Z, Babu K.
Cell Rep 2018;25:1856-1871.e6.
Nat Microbiol 2019;4:78-88.
Epstein-Barr virus BORF2 inhibits cellular APOBEC3B to preserve viral genome integrity.
Cheng AZ, Yockteng-Melgar J, Jarvis MC, Malik-Soni N, Borozan I, Carpenter MA, McCann JL, Ebrahimi D, Shaban NM, Marcon E, Greenblatt J, Brown WL, Frappier L, Harris RS.
Methods Mol. Biol. 2019;1864:37-48.
Ensifer-Mediated Transformation (EMT) of Rice (Monocot) and Oilseed Rape (Dicot).
Rathore DS, Zuniga-Soto E, Mullins E.
J. Virol. 2018.
Crustacean Genome Exploration Reveals the Evolutionary Origin of White Spot Syndrome Virus.
Kawato S, Shitara A, Wang Y, Nozaki R, Kondo H, Hirono I.
Am. J. Trop. Med. Hyg. 2018;99:1508-1510.
Molecular Evidence for Plasmodium falciparum Resistance to Sulfadoxine-Pyrimethamine but Absence of K13 Mutations in Mangaluru, Southwestern India.
Wedam J, Tacoli C, Gai PP, Siegert K, Kulkarni SS, Rasalkar R, Boloor A, Jain A, Mahabala C, Baliga S, Shenoy D, Devi R, Gai P, Mockenhaupt FP.

掲載情報につきまして
上記はGSL Biotech社ウェブサイト Citations ページより抜粋しております。

SnapGene機能詳細

SnapGeneは、日常的に行う遺伝子クローニングの作業手順を向上させるために開発されました。SnapGeneは、あなたが以下の作業を効率よく行うために必要なサポートを提供します。

分子クローニング

  • 制限酵素クローニング
  • Gatewayクローニング
  • Gibson Assembly
  • NEBuilder HiFi アセンブリ
  • In-Fusionクローニング
  • TA・GCクローニング
  • TOPOクローニング

プライマー

  • プライマーの設計
  • 2つのオリゴをアニーリングして二重鎖産物の形成

PCRおよび変異導入

  • シミュレートPCR
  • オーバーラップ伸長PCR
  • プライマー指向変異導入

ファイルのフォーマットの変換

  • アライメントフォーマット
  • ApE
  • CLC Bio
  • Clone Manager
  • DNA Strider
  • DNADynamo
  • DNASIS
  • DNAssist
  • DNASTAR Lasergene®
  • DS Gene
  • EMBL (ENA)
  • EnzymeX
  • GenBank / DDBJ
  • Gene Construction Kit®
  • Geneious
  • GeneTool
  • Genome Compiler
  • Jellyfish
  • MacVector
  • pDRAW32
  • Serial Cloner
  • Swiss-Prot
  • Vector NTI®
  • Visual Cloning

酵素セット

  • 制限酵素セット
  • 定義済み制限酵素セット - 企業またはカッターによる
  • カスタム制限酵素セットの作成
  • 詳細な制限酵素情報の表示
  • メチル化感受性とこれに関連するエラー回避に対する豊富なサポート

翻訳

  • 翻訳されたフィーチャーの表示および修正
  • オープン・リーディングフレーム(ORF)
  • 全シークエンスの翻訳
  • 遺伝子融合のリーディングフレームの確認
  • アミノ酸配列への翻訳 (DNAから)
  • 逆翻訳(アミノ酸配列から)

アライメント

  • DNAシークエンスをリファレンスシークエンスとアライメント
  • クローニングや変異導入の検証
  • cDNAを染色体にアラインメント
  • ペアワイズとマルチシークエンスのDNAとアミノ酸のアラインメント
  • アライメント・アルゴリズムの選択 - Clustal Omega、MAFFT、MUSCLE、
  • T-Coffee
  • コンティグ・アセンブリ

可視化

  • 複数のDNAシークエンス図の表示
  • 大きいシークエンスのサポート - 染色体サイズのシークエンスの閲覧
  • DNAやアミノ酸のシークエンスの修正
  • 色コードシークエンス

履歴の追跡

  • 包括的な「取り消し」機能
  • 産物のグラフィック履歴の表示
  • オプションの色の履歴を使用すると、シークエンスに対する最新の変更の識別が可能

アガロースゲル電気泳動の泳動パターンをシミュレート

  • 制限酵素処理のシミュレート
  • PCR反応の増幅のシミュレート
  • MWマーカー情報の大規模な収集

全般

  • プラットフォーム間の互換性 - Windows、macOS、Linux

SnapGeneシステム条件

SnapGeneのシステム条件は以下の通りです。インストール可能台数やライセンス許諾についてはFAQ:ライセンスについて をご参照下さい。

各OSシステム条件

Windows 7 以降 (SnapGene 5.1以降、64bitのみに対応)

macOS 10.10 以降

Fedora Linux 21 以降

Red Hat (CentOSを含む) Linux 7.2 以降

Ubuntu Linux 14.04 以降

HD空き容量 各OS共通

メモリ容量:1 GB RAM

HD空き容量:250 MB

ディスプレイ: 1024 x 768以上

 ご注意ください

Windows ARM版には対応していません

SnapGene製品カタログ

SnapGeneのデジタルカタログをダウンロードいただけます。

SnapGene製品カタログ